如何處理廁所污水這個問題是目前農村環境治理的一個難題，本身農村如何處理廁所污水并不難以解決，難以解決的是農村廁所污水的收集問題，和農村廁所建設問題。目前，環源環保了解，廁所依舊以旱廁為主，大部分依舊沒有污水收集管網，這也是造成廁所廢水難以集中處理的原因。目前國內外常見公廁污水處理工藝主要有厭氧處理、好氧處理、化學法、高溫高壓處理法(濕式氧化法)。

厭氧處理是現在常規的公廁污水處理，也就是目前市政上常見的化糞池工藝處理，優點為操作簡單，投資較少，運行費用低;缺點占地面積大，處理效果低，北方地區效果較差。好氧處理法：

　　利用好氧菌進行發酵的過程,稱之為好氧發酵。好氧處理規模小時,可只做***終稀釋后曝氣、沉淀;中等以上規模,經過前處理和二次稀釋后,可按標準活性污泥法進行處理。二次處理就是厭氧處理。好氧發酵的速度較厭氧發酵快得多,但它需要大容量的消化槽。同時在廁所污水處理過程中需要大量氧氣,因此要消耗大量的能量。

　　化學法：

　　在糞便中加入適量化學藥劑,使糞便發生絮凝作用,并通過沉淀分離成液體和脫水污泥。該處理法的特點是:糞便在較短的時間內形成固液分離。其不足之處在于:操作復雜,機械設備數量較多;分離出的液體BOD在5000mg/L左右,比厭氧發酵槽的脫離液2500mg/L要高得多。另外,其基建費及日常運行管理費用也較其它方法要高。隨化學藥劑的種類(如鐵鹽、石灰等)和投入方式的不同,其設備也不盡相同。藥劑的投加設備。有濕式和干式兩種濕式反應因混合均勻,所以效果較佳。投加添加劑的量,以糞便處理量的0.2%～2%為宜。

　　高溫高壓處理法(濕式氧化法)：

　　糞便中的有機物,在高溫高壓的條件下,經過約1h連續不斷地氧化分解可達到較好的處理效果。此種方法的關鍵在于反應塔的設計,它的容量,應根據糞便的發熱量、反應速度和氧化的程度來確定。

　　污水寶農村環境治理項目部認為目前國內外常見的廁所廢水處理還不能用在農村廁所污水處理上。污水寶農村環境治理項目部建議在農村如何處理廁所污水的問題上要因地制宜，條件允許的地方采用管網收集集中處理，經濟條件相對落后的地方采用分散處理，鑒于農村地區有足夠的土地，可以采用廁所水用作有機肥的辦法來處理。