醫院污水是一種低濃度污水，其中除含有有機和無機的污染物，如各種藥物、消毒劑、解剖遺棄等污染物外，還含有大量病毒、病菌和寄生蟲。成分比較復雜。

根據國家環保總局的有關規定（國家環保總局.醫院污水處理技術指南.2003.12（環發（2003）197號 ），將各類醫院按性質分為綜合醫院和傳染病醫院兩類，與衛生系統對醫院及醫療機構的劃分方法有差別。其中傳染病醫院指傳染性疾病專科醫院和帶傳染病房的綜合醫院，綜合醫院為不帶傳染病房的綜合醫院和各類非傳染性疾病的專科醫院。醫院污水凈化包括綜合醫院、中醫醫院、中西醫結合醫院、民族醫院和專科醫院（傳染病醫院（包括結核病院）、心血管病醫院、腫瘤醫院、口腔醫院、婦產科醫院和精神病醫院等等）各類醫院污水的處理，同時也包括療養院、康復醫院等其它醫療機構和獸醫院的污水處理工程。